Titulo Estágio
Brainviz - Visualização de dados de neuroimagem
Local do Estágio
ICNAS
Enquadramento
Neuroimagem representa um conjunto de várias técnicas de imagem que, direta ou indiretamente, apresentam informação relativa à estrutura e/ou função do sistema nervoso.
A necessidade de representar as complexas teias de relações que compõem as estruturas de dados provenientes das técnicas de neuroimagem fica frequentemente limitada pela nossa capacidade de representar de forma eficiente informação 2D (p.e. séries temporais de electroencefalografia), 3D (p.e. imagens de ressonância magnética estrutural) e/ou 4D (p.e. Dinâmica temporal de estruturas 3D).
Representações clássicas pouco intuitivas, com dados quantitativos, implicam por vezes perda de informação e pouca clareza na transmissão de conteúdos. Uma nova abordagem à visualização de dados de neuroimagem poderá permitir criar sínteses de grandes quantidades de informação, focar a comunicação nos aspectos essenciais, melhorar a interpretabilidade e transmitir de forma mais eficiente o trabalho de análise estatística dos dados.
Objetivo
Como objectivo, pretende-se a exploração de novas abordagens à visualização de informação associada a neuroimagem. O trabalho será realizado em coordenação com uma equipa multidisciplinar (com colaboradores com diversos backgrounds, que vão da engenharia informática, biomédica, psicologia e design).
A primeira fase consistirá em estudar/explorar os conceitos base de visualização de neuroimagem, assim como reconhecer quais os formatos de dados e ferramentas de desenvolvimento. Uma vez estabelecidos os requisitos, o candidato deverá explorar novas abordagens na apresentação/visualização da informação, acrescentando valor informativo, interpretabilidade aos paradigmas existentes. O resultado poderá ser uma ferramenta fundamental na disseminação de conteúdos relacionados com neuroimagem.
Plano de Trabalhos - Semestre 1
Estudo dos princípios básicos relativos à visualização de dados neuroimagem;
Estudo do estado da arte das ferramentas de visualização de dados de neuroimagem;
Estudo/levantamento de requisitos.
Plano de Trabalhos - Semestre 2
Desenvolvimento de protótipos/mockups em coordenação com a equipa de investigação;
Implementação de protótipos em datasets reais;
Escrita da dissertação.
Condições
Estágio a realizar nas instalações do ICNAS. O aluno será integrado no seio de uma equipa jovem e multidisciplinar (inclui elementos das áreas de Eng. Informática, Eng. de Design e Multimédia, Eng. Biomédica, Psicologia e Medicina).
Orientador
Hélio Jorge Simões Gonçalves
heliomail1.1@gmail.com 📩